Ud over at hæmme væksten og reproduktionen af mikroorganismer har vakuumdeoxygenering en anden vigtig funktion til at forhindre fødevareoxidation. Fordi fedtet mad indeholder en masse umættede fedtsyrer, oxideres det ved påvirkning af ilt, hvilket får maden til at smage dårligt og fordærvet. Derudover medfører oxidation også tab af vitamin A og vitamin C, og de ustabile stoffer i madfarve påvirkes af ilt til at mørke farven. Derfor kan deoxygenering effektivt forhindre fødevarefordærvelse og bevare dens farve, aroma, smag og næringsværdi.
